Laboratuvarın ana amacı çıkarılan kalıntıları almak ve kayıp şahsın kimlik tespitini yapabilmek için bilimsel antropolojik analizler yürütmektir. Bu amaca yönelik bilimsel çalışma ise en üst düzeyde bilimsel yeterlilik ve etik kurallara uygunluk sağlamak amacıyla Standart Çalışma Prosedürlerini takip eden iki tane iki-toplumlu antropolog ekibi tarafından gerçekleştirilir.

Antropolojik analizle kişinin cinsiyeti, boyu, ölüm sırasındaki yaşı da dahil olmak üzere kimlik tespitinin başarılı olmasını sağlayacak başka kişisel özelliklerin de belirlenmesi yoluyla biyolojik profil çıkarılır. Bunların yanı sıra yapılan analiz, çıkarılan kalıntıların geldiği yeri, KŞK’nın görev tanımıyla uyumlu olup olmadığını ve kalıntıların tek bir kayıp şahsa mı yoksa iki veya daha fazla kayıp şahsa mı ait olduklarını belirler. Çok sayıda kayıp şahsın söz konusu olması halinde yapılan işleme Minimum Birey Sayısı (MNI) tespiti adı verilir. Bulguların birden fazla bireye ait olması halinde karışık haldeki kalıntılar ailelere verilmek üzere ilişkilendirilerek olabildiğince eksiksiz şekilde ayrıştırılırlar. Antropolojik analizden sonra küçük kemik numuneleri kesilerek genetik analiz için DNA laboratuvarına gönderilirler.