Η ΔΕΑ έχει τρία Μέλη, δύο διορισμένα από την Ελληνοκυπριακή και Τουρκοκυπριακή κοινότητα αντίστοιχα και ένα τρίτο Μέλος που επιλέγεται από τη Διεθνή Επιτροπή του Ερυθρού Σταυρού και διορίζεται από τον Γενικό Γραμματέα των Ηνωμένων Εθνών. Επιπλέον, η ΔΕΑ απασχολεί μια δικοινοτική ιατροδικαστική ομάδα περισσότερων από 60 Κύπριων αρχαιολόγων, ανθρωπολόγων και γενετιστών, οι οποίοι πραγματοποιούν ανασκαφές σε όλο το νησί και ανθρωπολογικές και γενετικές αναλύσεις λειψάνων στο Ανθρωπολογικό Εργαστήριο της ΔΕΑ.

Η ΔΕΑ δεν επιχειρεί να διαπιστώσει την αιτία θανάτου ούτε να αποδώσει ευθύνη για το θάνατο αγνοουμένων. Ο στόχος της είναι ανθρωπιστικός, θέλοντας να κλείσει αυτό το ανοικτό κεφάλαιο στις χιλιάδες πληγείσες οικογένειες μέσω της επιστροφής των λειψάνων των αγνοουμένων συγγενών τους.